Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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