Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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