Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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