Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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