Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms