Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms