Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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RPA4Q13156 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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