Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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