Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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