Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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IFT88Q13099 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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IFT88Q13099 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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IFT88Q13099 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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IFT88Q13099 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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