Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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