Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms