Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms