Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms