Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms