Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HBBP68871 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
HBBP68871 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HBBP68871 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HBBP68871 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HBBP68871 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HBBP68871 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HBBP68871 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms