Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP107P57740 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms