Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN8P56748 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms