Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms