Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms