Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPAP53621 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COPAP53621 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COPAP53621 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPAP53621 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms