Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSEN1P49768 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms