Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLK1P49759 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms