Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NESP48681 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NESP48681 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NESP48681 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NESP48681 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NESP48681 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NESP48681 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms