Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFMP43652 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFMP43652 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AFMP43652 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms