Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMPOP42166 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms