Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms