Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORAP35398 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORAP35398 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms