Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms