Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1CP29017 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1CP29017 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1CP29017 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1CP29017 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1CP29017 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1CP29017 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms