Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms