Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRAFP15056 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRAFP15056 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRAFP15056 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRAFP15056 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRAFP15056 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRAFP15056 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRAFP15056 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRAFP15056 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRAFP15056 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms