Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNT1P13805 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNT1P13805 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms