Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms