Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IFITM1P13164 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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