Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms