Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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