Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRATO95237 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRATO95237 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRATO95237 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRATO95237 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms