Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms