Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms