Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms