Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms