Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MAP3K4Q9Y6R4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms