Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms