Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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