Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP20Q9Y2K6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP20Q9Y2K6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms