Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms