Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms