Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN11AQ9UI33 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms