Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms